| Platz | Verein | Sp. | P. |
| 1. | VfL Osnabrück | 27 | 46 |
| 2. | 1. FC Heidenheim 1846 | 26 | 44 |
| 3. | FC Ingolstadt 04 | 26 | 42 |
| 4. | Kickers Offenbach | 27 | 42 |
| 5. | Erzgebirge Aue | 25 | 41 |
| 6. | Eintracht Braunschweig | 25 | 38 |
| 7. | SV 1916 Sandhausen | 25 | 37 |
| 8. | Jahn Regensburg | 24 | 35 |
| 9. | Rot-Weiß Erfurt | 25 | 35 |
| 10. | Carl Zeiss Jena | 24 | 34 |
| 11. | Wacker Burghausen | 24 | 33 |
| 12. | SV Werder Bremen II | 24 | 32 |
| 13. | FC Bayern München II | 23 | 32 |
| 14. | SpVgg Unterhaching | 26 | 31 |
| 15. | Dynamo Dresden | 24 | 30 |
| 16. | Borussia Dortmund II | 24 | 29 |
| 17. | VfB Stuttgart II | 24 | 27 |
| 18. | Wuppertaler SV | 24 | 26 |
| 19. | SV Wehen Wiesbaden | 25 | 26 |
| 20. | Holstein Kiel | 24 | 25 |